De mucosa is de binnenste laag van de wand van slokdarm, maag en darm. Veel voorstadia van darmkanker en sommige zeer vroege tumoren groeien aanvankelijk alleen in deze laag. De endoscopische mucosaresectie, kortweg EMR, verwijdert ze gericht – via een endoscoop en zonder uitwendige snede.
Voor de meeste poliepen volstaat bij een coloscopie een tangetje of een eenvoudige lus. Grote, vlakke of breed op de wand zittende afwijkingen liggen daarentegen dicht tegen de darmwand aan en zijn zo nauwelijks volledig te vatten. Daarvoor is EMR bedoeld, in de dikke darm vaak bij poliepen vanaf ongeveer twee centimeter. Ook in slokdarm en maag wordt EMR toegepast, bijvoorbeeld bij celveranderingen in een Barrett-slokdarm: slijmvlies dat is veranderd door terugstromend maagzuur.
Eerst wordt vloeistof onder de afwijking gespoten. Dat kussentje tilt het slijmvlies op van de diepere spierlaag en schept afstand tot de rest van de darmwand. Een lus omvat dan de afwijking en snijdt die met hoogfrequente stroom los, kleinere in één stuk, grote meestal in meerdere. Daarna worden de randen dichtgebrand; plekken met een verhoogd bloedingsrisico kunnen met kleine clips worden gesloten.
Elk verwijderd stuk wordt in het laboratorium onderzocht. De uitslag laat zien of het om een goedaardig voorstadium of een vroege tumor ging en, als in één stuk is verwijderd, of de rand vrij is. Bestaat al vóór de ingreep het vermoeden dat een tumor dieper in de wand reikt, dan komen andere wegen in aanmerking: de submucosale dissectie, waarbij de afwijking in één stuk wordt losgemaakt, of een operatie.